> 同人系のホームページの注意書きにある「ネット禁」とは
> どういった意味なのでしょうか。
> 教えてください。よろしくお願いします。

同人誌に書いてある場合ではおそらく「ネットへの転載を禁止する」
という意味でしょうが、
(同人やってる人がネットにあまり多くなかったころは
よく無断で同人誌取り込んでページを作ったりされていた)

ホームページの注意書きにある場合は…正直言ってよくわかりません。
正直言って、ワタシ自身が同人系のHPでその注意書きを見たことないので…^^;